芦屋瑞稀（堀北真希）は、アメリカの高校から桜咲学園に編入してきた高校2年生。登校初日、期待に胸膨らませ学校へと向かう瑞稀は、いきなり衝撃的な場面を目の当たりにする。寮から学園までの約30メートルの距離を女子中高生が埋め尽くし、そこを通る男子生徒たちに悲鳴混じりの声援を送っているのだ。男子生徒たちもまんざらでもない様子で手を振り返し、その姿は、まるで凱旋パレードのよう。驚く瑞稀に、そこで写真を撮っている原秋葉（紺野まひる）が声をかける。原によれば、桜咲学園は生徒を偏差値よりも顔で選ぶイケメン揃いの男子校だが、全寮制のため彼らを拝めるのは、寮から学園までのわずか30メートルの距離だけ。そのため、イケメンたちを狙った“デマチ”と呼ばれるファンが毎朝、こうやって集まってくるのだと。
そんな喧騒をすり抜け、転校先となる2年C組の教室へやってくる瑞稀。そこで待っていたのは、中津秀一（生田斗真）ら男子生徒たちからの手荒い歓迎の儀式だった。からかわれ、ふらつきながらも瑞稀が席に着くと、生徒たちの冷ややかな視線が注がれる。と、そこへひとりの生徒が入ってくる…佐野泉（小栗旬）だ。その顔を見て、瑞稀は思わずはっとする。実は、瑞稀はアメリカにいた中学時代に、将来有望な高跳びの選手として活躍する佐野のジャンプを見て感動、以来、大ファンに。しかし、佐野はある事件をきっかけに高跳びをやめていた。そして瑞稀はそんな佐野に再び跳んでほしいと願い、性別を偽り編入してきたのだ。瑞稀のそんな思いなどまったく知らない佐野は、あくまでクールな態度で…。
全寮制の桜咲学園には、天王寺恵（石垣佑磨）が率いる格闘系の第一寮、難波南（水嶋ヒロ）が率いるスポーツ系の第二寮、オスカー・M・姫島（姜暢雄）が率いる演劇系の第三寮と三つの寮がある。各寮は、間近に迫ったマラソン大会に向け、競い合っていた。なぜなら、優勝者の寮には、全員に土日外泊1年間という特典が与えられるという。足が速いとすでに評判の瑞稀の獲得に各寮は必死だ。難波に第二寮を案内されていた瑞稀は、幽霊が見えるという萱島大樹（山本裕典）に、意味深な笑みで「面白いオーラをしている」と言われあせる。がしかし、佐野が第二寮だと聞き、即座に入寮。二人は、同室になる。
そんな折、第二寮でマラソン大会の選手を選抜する会議が開かれ、中津、難波、陸上部の関目京悟（岡田将生）が早々と決定する。自薦するも相手にされない中央千里（木村了）を尻目に、瑞稀に声がかかるが、ためらっていると中津が佐野を推薦。ケガは治っているから平気なはずだと喧嘩をふっかける。そこで瑞稀は、佐野を助けるために立候補する。部屋に戻った瑞稀が荷物の整理をしていると、佐野が戻ってくる。迷惑そうに話す佐野に瑞稀がどぎまぎしていたとき、持ち上げたダンボールの底が抜け、中から佐野の写真が出てくる。それを見た佐野は不審がるが、瑞稀は答えられず、とっさに、なぜ高跳びを辞めたのかと、佐野に理由を尋ねる。しかし佐野は、冷たく瑞稀を突き放す。
そして、マラソン大会当日。校庭に勢ぞろいする生徒たちのなかで、瑞稀もウォーミングアップをはじめる。と、そのとき、何者かが瑞稀の足を踏みつける。短距離用の鋭いポイントがついたスパイクで踏まれた瑞稀は、激痛に顔を歪める。シューズには、うっすらと血の跡もにじんできて…。そんな中、校長・椿（松田聖子）のピストルの合図で、生徒たちは一斉にスタートする。
同じ頃、初対面から瑞稀に対して鋭い視線を向けていた保健医・梅田北斗（上川隆也）は職員室にしのびこみ…。

　保健室に運ばれたことで、校医・梅田北斗（上川隆也）に女だとバレてしまった芦屋瑞稀（堀北真希）は、梅田から男子校に編入してきた理由を問い詰められ、絶体絶命のピンチに。と、そこへ、第二寮で飼っている犬の裕次郎が現れ、瑞稀は間一髪、脱出に成功する。外へ出た瑞稀は、裕次郎が佐野泉（小栗旬）の元へ駆け寄るのを見て、佐野が自分を助けるために裕次郎をよこしたのだと思い、礼を言う。ところが佐野は、瑞稀のためにそんなことをするわけがないと、相変わらず悪態をつく。
その夜、食堂にいた瑞稀たちは、教頭・猿渡（宇梶剛士）から、次のイベントとして「ミスター桜咲コンテスト」が開催されると聞く。それは、桜咲学園と姉妹校である女子高・聖ブロッサム学園が共催し両校の“キング”と“クイーン”を選ぶコンテストで、つまり一番イケている男女を選ぶというもの。ファンクラブによる途中経過が報告される中、中津秀一（生田斗真）が瑞稀を呼び出すが、中津の様子は何だか変。
各寮は早速準備について話し合われ、瑞稀の第二寮でも寮長・難波南（水嶋ヒロ）の下、看板を制作することが決まる。そこで、地下倉庫にある去年の看板を参考にするため、誰かが看板を取りにいくことに。結局、瑞稀が行くはめになるのだが、場所がわからないうえ、暗い倉庫に行くのをためらう瑞稀に、佐野が突然、自分も一緒に行くと言い出す。懐中電灯を照らし、瑞稀とやってきた佐野だが、なぜか足がふらついている。電気を見つけスイッチを押そうとした瞬間、佐野は倒れ込み、瑞稀と至近距離に。すると、いきなり、佐野は瑞稀に…。そこへ、瑞稀を心配した中津、難波、萱島大樹（山本裕典）、関目京悟（岡田将生）、中央千里（木村了）がやってくる。
翌日、佐野と目が合った瑞稀は、ドギマギしながら昨日のことを切り出すが、佐野はまったく記憶にない様子。覚悟はしていたものの、瑞稀はショックを隠せない。そんなふたりのやりとりを見ていた中津に、萱島が「ピンクのオーラが出てるよ」と指摘。中津は、ドキリとする。
そんな折、“ミスコン”の出場権利が与えられた10人の生徒名が発表になる。姫島正夫（姜暢雄）、天王寺恵（石垣佑磨）、中津、難波、関目らに混じって、佐野と瑞稀も選出されるが、佐野は去年同様、出場しないだろうとすでに評判がたっている。
夕方、帰宅しようとする瑞稀は、思いがけず会った梅田から、佐野が陸上部を辞めたと聞かされる。初めて聞く、衝撃的な事実を確かめるため、瑞稀は佐野を探しに行くが…。

　芦屋瑞稀（堀北真希）は、アメリカにいるはずの兄・静稀（岡田義徳）が、自分を連れ戻しに日本に来ているというメールを受け取り愕然とする。さらに、「最愛の妹へ」と書かれたそのメールを佐野泉（小栗旬）に見られてしまう。佐野は、寝起きで朦朧としていたが…。
その頃、桜咲学園の姉妹校・聖ブロッサム学園の寮で女生徒の下着が盗まれる事件が頻発、桜咲学園の生徒たちも犯人探しをすることに。ある生徒はウソ発見器を作り、中津秀一（生田斗真）が最初の実験台にされる。その意外な反応に難波南（水嶋ヒロ）、萱島大樹（山本裕典）らが盛り上がる中、寮の周りをうろついていた怪しい男が食堂に連行された。なんと男は静稀だった。静稀が瑞稀の兄だと知り、関目京悟（岡田将生）や中央千里（木村了）ら驚く一同。慌てた瑞稀は、静稀を自室に連れ込むが、瑞稀が男に扮して桜咲学園に転校したのは、佐野への恋愛感情からだろうと問い詰められる。瑞稀は佐野が高跳びを止める原因を作ったのは自分なので、今度は佐野を復帰させる手伝いがしたいだけだと説明する。静稀は、瑞稀が責任を感じる必要はないと言うが、瑞稀はどうしても佐野に高跳びに復帰してもらい、笑顔を見せてほしいと譲らない。そんなふたりのやりとりを、佐野は部屋の前で聞いていた。
瑞稀の気持ちを知ってもまだ納得しない静稀は、翌日、退学の申請にやってきた。しかし、校長が不在だったため、保健医の梅田北斗（上川隆也）が代わりに対応する。そして瑞稀と梅田が保健室に行くと、そこには原秋葉（紺野まひる）がいた。原は、1冊の陸上雑誌を見せ、佐野の弟・森（大東俊介）が高跳びの選手で新星として期待を集めていること、二人の父親もかつてオリンピック選手だったことを話す。同じ頃、静稀は佐野を呼び出し、瑞稀の佐野への思いを代弁し、復帰の可能性が低い佐野のために、貴重な学生時代を棒に振るのは兄として認められないので、瑞稀をアメリカへ連れて帰ると決意を述べる。そんな静稀に佐野は答えることができない。
その夜、瑞稀が部屋で佐野森の記事を読んでいると、佐野が帰ってくる。話しかけても返事もしない佐野に、瑞稀は自分たち“兄弟”の話を始める。それは、きっと佐野は森のことを気にしているだろうと瑞稀なりの気遣いだった。しかし、佐野は瑞稀に、自分は二度と跳ぶつもりもないし、兄と一緒にアメリカに帰ればいいと激怒。そして自分の願いは瑞稀が視界から消えることだとまで言い放つ。佐野の言葉にショックを受けた瑞稀の頬には涙が伝い…。

　第一寮が水道工事のために一時的に閉鎖されることになり、第一寮の生徒たちは、第二寮、第三寮にふりわけられた。芦屋瑞稀（堀北真希）と佐野泉（小栗旬）の205号室には、なぜか第二寮の中津秀一（生田斗真）がやってくる。瑞稀のことが気になる中津は、205号室に入室が決まっていた生徒に頼み込んで、自分が入れるように工作したのだ。205号室にやってきた中津は、瑞稀と生活できることに大興奮。あたふたと不審な行動を取り始める。
夏休みが近づき、運動部では合宿の開催が話題に上る。佐野も陸上部主将の関目京悟（岡田将生）に声をかけられるが、まったく興味を示さない。
そんな折、教頭の猿渡（宇梶剛士）から、桜咲学園とブロッサム学園の選出者10名ずつによる合コンが行われると発表される。桜咲学園から選ばれるのは、ブロッサムの女子が「恋人にしたい」と思うランキングの上位10名だという。女心を掴むにはどうしたらいいのか、生徒たちはそれぞれ自己PRの方法を必死で模索する。そんな中、ついに合コンのメンバーが発表。難波南（水嶋ヒロ）、天王寺恵（石垣佑磨）、姫島正夫（姜暢雄）らに交じって、瑞稀、佐野、中津、関目も選出される。選出にもれた萱島大樹（山本裕典）、中央千里（木村了）らは、ジャッジ席から合コンの行方を見守ることに。
数日前、佐野から存在を否定されるようなことを言われ傷心していた瑞稀は、努めて明るく振る舞うが、佐野の態度は相変わらず。しかも、毎晩、寮で飼っている犬・裕次郎の散歩だと言い、まるで瑞稀を避けるように出掛けていく様子も気になっていた。そこで、カメラマン・原秋葉（紺野まひる）を訪ね、佐野の弟で高跳びの新星・森（大東俊介）のことを聞く。佐野の態度に、森のことが影響していると思ったからだ。秋葉が、森が近隣の桃郷学院に練習に来ているから直接、本人に会ってみればとアドバイス。校医・梅田北斗（上川隆也）は、余計なことはするなと釘をさすが…。

　夏休みになり、芦屋瑞稀（堀北真希）は、中津秀一（生田斗真）、難波南（水嶋ヒロ）、萱島大樹（山本裕典）、中央千里（木村了）と海の家にやってくる。半ば強引に連れてこられた瑞稀だったが、海に花火にと、夏をエンジョイしようと気持ちを切り替える。ところが、海の家に降り立つと、瑞稀たちの目前に仁王立ちで立ちはだかる女性が。海の家を取り仕切るこの女性は、なんと、難波の母・伊緒（森口瑤子）だという。翌日の、海の家リニューアルオープンに備えて、人手が必要な伊緒は、息子に友人たちを連れてくるように指示していたのだ。そうとは知らない瑞稀たちだったが、伊緒の勢いに押され、あれこれと仕事を手伝わされる。
その後、仕事を終えた瑞稀と中央は、伊緒に頼まれて浜辺に難波を探しに行く。プレイボーイの難波だけあって、また女性と一緒だったのだが、難波はいつもとは違う暗い表情をしていて、ふたりは声をかけられない。海の家に戻ったあと、瑞稀は思い切って難波に一緒にいた女性のことを尋ねる。彼女は田辺可南子（原田夏希）といって、難波の中学のときの家庭教師であり、元カノだとのこと。しかも、難波が唯一、本気で惚れた女性なのだと言う。そう話す難波に、中央はショックを受ける。
一方、佐野泉（小栗旬）は、関目京悟（岡田将生）たちと陸上部の合宿に来ていた。ブランクのある佐野のため、陸上部の顧問である校医・梅田北斗（上川隆也）は、佐野につきっきりで筋力トレーニングの指導をするが、ほかの部員たちは特別扱いされる佐野が面白くない。
翌朝、瑞稀、中津、萱島、中央は、仕事を他人に任せ、浜辺に遊びにやってくる。すると、そこで、桃郷学院の神楽坂真言（城田優）と鉢合わせる。相変わらず高飛車な神楽坂と口論するうち、瑞稀たちは、神楽坂率いる桃郷学院の面々と、桜咲学園の面々の「どっちがイケてるか」を競う対決をする約束を交わしてしまう。海の家に戻ると、急に意気消沈してしまう瑞稀たち。誰か、助っ人を…という話題になったとき、なぜか、天王寺恵（石垣佑磨）と姫島正夫（姜暢雄）が現れる。
その頃、陸上部の合宿では、突然、部活に復活して全国大会を目指そうとする佐野に納得できない部員たちが、佐野がどれくらい本気なのか試したいと梅田に直談判。翌日の合宿の最終日に、地区大会の標準記録を跳べたら、入部を認めるというのだ。まだ、跳んでいない佐野だが、引き受けざるをえない。その夜、合宿所に戻った佐野に、関目が携帯電話を差し出す。瑞稀たちが泊まっている海の家にかかっているという。観念したように電話を受け取った佐野は、電話に出た相手に瑞稀を呼び出してもらい…。

　海の家での滞在を終えた芦屋瑞稀（堀北真希）は、中津秀一（生田斗真）ら生徒たちと寮へ戻ってくる。同じ頃、陸上部の合宿に参加していた佐野泉（小栗旬）も、すでに戻っていた。中津は、海の家から佐野に会うために合宿所へ行った瑞稀が、気落ちした様子で海の家に戻ってきたことが気になっていた。寮に戻り、瑞稀にそのことを尋ねるが、瑞稀は答えようとしない。瑞稀は、佐野を追い詰めているのは自分だと思い、佐野に会うのが怖くなっていたのだ。
その頃、佐野は桜咲学園のグラウンドで高跳びの練習をしていた。まだバーを越えることができないが、陸上部部長の関目京悟（岡田将生）が、そろそろ引き上げようと声をかけても止めようとしないほど、練習に集中している。そして、そんな佐野が跳ぶ姿を撮ろうと、カメラマンの原秋葉（紺野まひる）が狙う。すると、そこへ、佐野のライバル、桃郷学院の神楽坂真言（城田優）が現れる。いつもの調子で悪態をつく神楽坂だったが、そんななか言った「足癖が悪い」という一言に、佐野はハッとする。神楽坂は、暗に佐野のフォームが悪いことを指摘していたのだ。その言葉にヒントを得た佐野は、再び練習に熱を入れる。
瑞稀は保健室に校医の梅田北斗（上川隆也）を訪ね、佐野のことを相談する。瑞稀は、自分が桜咲学園に来れば、佐野は高跳びと向かいあい、すぐに跳べるようになると思っていたが、そんな自分は間違っていたと落ち込んでいた。梅田は、佐野は今は苦しんではいるが、跳ぶことで自分を取り戻そうとしているんだと、諭すように話す。
そんな折、瑞稀の両親がアメリカからやってくる。突然の来訪に驚きながらも、母・英子（筒井真理子）父・拓見（山崎一）と久しぶりに親子水入らずの時間を過ごす。
一方、学園では「桜咲学園に眠る宝を見つけ出せ」という校長からの指示の下、今度は宝探しをすることに。難波南（水嶋ヒロ）、中央千里（木村了）の第二寮、天王寺恵（石垣佑磨）の第一寮、オスカー・M・姫島（姜暢雄）の第三寮がいがみ合うようにスタートを切る。
瑞稀が英子とショッピングを楽しんでいると、中津から「これから会いたい」という連絡が入る。なんとなく断れなかった瑞稀は、夕食には戻ると英子に約束をして、中津が待つ場所へ。ところが、やってきた瑞稀が目にしたのは、誰かを待っている様子の佐野の姿だった…。

　芦屋瑞稀（堀北真希）らの2年C組に、臨時教員の北浜昇（稲垣吾郎）がやってくる。生徒たちはいつものとおり手荒いいたずらで迎えるが、北浜はまったく動じない。そして、何か問題を起こせば停学処分にすると宣言する。その冷徹な態度に、生徒たちもペースを狂わされてしまう。
学園は定期テスト期間に入るが、生徒たちは勉強するどころか、テストの後に行われる『桜咲学園定期テスト打ち上げライブ』のことでいっぱい。出し物の練習に余念がない。
瑞稀が、中津秀一（生田斗真）と部屋で勉強していると、佐野泉（小栗旬）が帰ってくる。相変わらず高跳びに打ち込む佐野に、瑞稀はテストは大丈夫かと尋ねるが、実は佐野は、瑞稀たちに勉強を教えるほど成績優秀。逆に、瑞稀と中津が勉強を教えてもらう羽目に。
そして、翌日。いよいよ、テストが始まる。必死に解答用紙に向かう生徒たちの間を、見回り歩く北浜。すると、中津の机で何かを見つける。解答用紙の下にもう一枚、紙があったのだ。どうやら、着席のときに紛れ込んだらしいのだが、北浜は、カンニングだと断定。中津は、テスト終了後に呼び出される。いくら説明しても、信じようとしない北浜に困惑した教頭の猿渡（宇梶剛士）が、テスト期間を理由に真偽の保留を提案。中津は、ひとまず解放されるが、身の潔白は証明されないままだ。教室に戻った中津に、瑞稀らクラスメイトたちが心配して声をかける。
その夜、難波南（水嶋ヒロ）は、第二寮の関目京悟（岡田将生）、中央千里（木村了）らを集めて打ち上げライブについて話し合い、「モテそうだから」という理由で、バンドをやることに。瑞稀も盛り上がるが、中津の表情は冴えない。
そして、テスト最終日。テストから解放されたのもつかの間、中津はカンニングの事情聴取のため、北浜に連れていかれる。その夜、瑞稀は、食堂に萱島大樹（山本裕典）ら生徒たちを集めると、中津の無実を晴らすために協力してほしいと頼むが、逆に犯人が誰なのかという議論が勃発。寮ごとに一触即発の雰囲気になってしまう。
翌日、打ち上げライブのリハーサルが行われることになり、寮ごとに演奏を披露し始める。するとそこへ、北浜が現れリハーサルの中止を言い渡す。その強権ぶりに、生徒たちも、渋々従うしかない。
その頃、校医の梅田北斗（上川隆也）が保健室にいると原秋葉（紺野まひる）がやってきて、打ち上げライブ自体が延長になったことを聞き…。

　芦屋瑞稀（堀北真希）が女であると知った中津秀一（生田斗真）は、衝撃を受ける。
そんな折、学園では『桜咲＆ブロッサム「エドワード・J・ハリソン杯」舞踏会』が開催されることになる。これは、桜咲学園とブロッサム学園から選ばれた男女7組のペアで踊る舞踏会で、社交性を磨く目的で開かれるのだという。生徒たちが早速、準備に取り掛かり始めると、そこへ、練習帰りの佐野泉（小栗旬）がやってくる。いつもなら素通りするはずの佐野だが、何を思ったか準備を手伝うといい、周囲を驚かす。
翌朝、瑞稀はどこかへでかけようとする佐野の後を追う。やがて、ふたりは佐野が強化合宿に参加することになった桃郷学院にやってくる。すると、その前に一台のバスが止まり、中から佐野の弟・森（大東俊介）をはじめとした強化選手が続々と降りてくる。次の瞬間、佐野はバスから降りてきた大人の男性に目を奪われる。その男性は、佐野と森の父親である佐野岳彦（杉本哲太）だった。
イベントの準備に忙しい学園では、ブロッサムガールズ数人が食中毒で倒れたとのニュースが伝わる。舞踏会を数日後に控え、7組必要なカップルが5組しか揃わなくなるという。難波南（水嶋ヒロ）や関目京悟（岡田将生）は中止を提案するが却下され、結局、足りない女子の分を桜咲学園の男子生徒が女装して補うということに。難波のパートナーに決まった中央千里（木村了）は大はしゃぎ。あとは、中津のパートナーを探すだけとなる。
そんなところへ、困惑したままの中津が食堂へ入ってくる。と、そこには、ドレスを着て女装した瑞稀が立っていた。萱島大樹（山本裕典）のアドバイスもあり、中津は、瑞稀の手を取り踊り始める。
一方、練習の準備をしていた佐野は、森に桃郷学院に岳彦がいる理由を尋ねる。すると、神楽坂真言（城田優）が来て、岳彦こそがこの強化練習の提案者だと言う。

　芦屋瑞稀（堀北真希）は、父親・佐野岳彦（杉本哲太）のことで口論となった佐野泉（小栗旬）と関係修復ができないまま、中津秀一（生田斗真）から突然の告白を受け、思い悩む。
そんな折、桜咲学園が全国高校陸上競技大会の予選会場に選ばれ、その開会式を盛り上げるため、生徒たちはパフォーマンスをすることに。難波南（水嶋ヒロ）、関目京悟（岡田将生）、中央千里（木村了）ら生徒たちははじめ面倒くさがるが、教頭・猿渡（宇梶剛士）から参加した寮にはハワイ旅行が贈られると聞き、全寮俄然やる気に。その様子を見ていた萱島大樹（山本裕典）は、波乱の幕開けを感じる。
一方、桃郷学院のグラウンドで弟・佐野森（大東俊介）を指導する岳彦を見ていた佐野は、岳彦と対峙したいとも思うがその一歩が踏み出せず、グラウンドを後にする。
校医・梅田北斗（上川隆也）に言われ、桃郷学院まで佐野に会いに来た瑞稀だったが、佐野とは行き違ってしまう。ところが、そこで目にしたのは、担架に乗せられ運ばれる岳彦の姿だった。
瑞稀は大急ぎで寮に戻ると佐野に報告し、病院へ行くように促すが、佐野は動揺しながらも動こうとしない。そんな佐野にしびれを切らした瑞稀は、部屋を飛び出す。結局、後を追ってきた佐野をタクシーに乗せ、病院へ送る。
佐野が駆けつけると、病室には森がいた。容態が落ち着いた岳彦と佐野は、少しずつではあったが歩み寄ることができた。
その夜、寮の部屋に戻った佐野は、瑞稀に岳彦とのことを話し、ふたりの間に笑顔が戻る。
そして、いよいよ陸上競技大会開会セレモニーのパフォーマンス参加権を巡って、寮ごとの勝負が始まる。原秋葉（紺野まひる）は、寮ごとの勝負のはずなのに、どうも佐野と中津の様子が妙だと言う。事情を知る梅田は、男には勝負しなければいけない時があると言い…。

　芦屋瑞稀（堀北真希）は、パスポートの入った財布を落としてしまい、必死に捜すが見つからない。佐野泉（小栗旬）、中津秀一（生田斗真）も見覚えがないと言うが、財布にパスポートが入っていたことを聞いた佐野は嫌な予感がする。中津は佐野を呼び出すと、財布を拾ったのは花屋敷ひばり（岩佐真悠子）で、難波南（水嶋ヒロ）、天王寺恵（石垣佑磨）、オスカー・Ｍ・姫島（姜暢雄）の三寮長にパスポートを見せようとしていたと報告する。なんとかそれは阻止したので、三寮長はパスポートを見ていないが、学園に女がいることは知ってしまったようだと言う。佐野と中津は、この件は自分たちで解決しようと合意。早速、佐野はひばりを呼び出すと、財布を返してほしいと頼むが、ひばりは聞き入れない。
そんな折、今度は『桜咲学園祭』が開催されることが発表され生徒たちは盛り上がる。学園祭は、寮対抗ではなくクラス対抗ということで、瑞稀は萱島大樹（山本裕典）、関目京悟（岡田将生）らクラスメイトと出し物の相談をし、中央千里（木村了）が提案した「メイド喫茶」をやることになる。
その後、瑞稀は体育の授業に出るため、いつものように学園の体育倉庫で着替え始める。ところが、倉庫の窓が開いていたため、着替える姿を難波、天王寺、姫島に見られてしまう。顔こそ見えなかったが、明らかに女がいることを見てしまった三人は愕然とする。
何も知らない瑞稀が学園祭の打ち合わせに出ていると、関目がやってきて、桜咲学園に女がいるらしいと、発表する。それを聞いた生徒たちは、寮ごとにその女探しをすることに。さまざまな方法が試され、梅田北斗（上川隆也）や原秋葉（紺野まひる）まで捜査対象になるが、結局、見つけ出すことができない。しかし、生徒たちの中から、その女は自分たちをだました裏切り者で、許せないという声があがり、ホッとしたのもつかの間、瑞稀は大きなショックを受ける。
その頃、海外赴任中だった校長・椿（松田聖子）が、学園へと戻ってきて…。